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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5fmrC_ | 2.00 | PDB header: transport protein | Chain: C: PDB Molecule: intraflagellar transport protein component ift52; |
Added to library: Sat Mar 12 08:30:55 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | R | I | L | F | S | T | A | K | G | E | S | H | T | H | K | A | G | F | K | Q | L | F | R | R | L | R | S | T | Y | R | P | D | K | V | D | K | D | D | F | T | L | D | T | L | R | S | A | H | I | L | V | L | G | G | P | K | E | K | F | T | A | P | E | V | D | M | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | T | B | T | T | S | G | G | G | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | F | V | K | N | G | G | S | I | L | I | L | M | S | E | G | G | E | E | K | A | G | T | N | I | N | Y | F | L | E | Q | F | G | M | S | V | N | N | D | A | V | V | R | T | T | H | Y | K | Y | L | H | P | K | E | V | L | I | S | D | G | I | L | N | R | A | V | I | T | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | B | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | R | V | F | D | G | T | G | L | E | Y | V | F | P | F | G | A | T | L | S | V | Q | K | P | A | V | P | V | L | S | S | G | K | I | A | Y | P | M | N | R | P | V | G | A | V | W | A | Q | P | G | Y | G | R | I | A | V | L | G | S | C | A | M | F | D | D | K | W | L | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | |||||||
Sequence | E | E | N | S | K | I | M | D | F | F | F | K | F | L | E | P | H | S | K | I | Q | L | N | D | I | D | A | E | E | P | D | V | S | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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