|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5fmaA_ | 2.46 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: neurogenic locus notch homolog protein 1; |
Added to library: Sat Apr 16 08:57:58 2016 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | Q | D | P | C | A | S | N | P | C | A | N | G | G | Q | C | L | P | F | E | S | Y | I | C | H | C | P | P | S | F | H | G | P | T | C | R | Q | D | V | N | E | C | G | E | K | P | G | L | C | R | H | G | G | T | C | H | N | E | V | G | S | Y | R | C | V | C | R | A | T | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | P | N | C | E | R | P | Y | V | P | C | S | P | S | P | C | Q | N | G | G | T | C | R | P | T | G | D | V | T | H | E | C | A | C | L | P | G | F | T | G | Q | N | C | E | E | N | I | D | D | C | P | G | N | N | C | K | N | G | G | A | C | V | D | G | V | N | T | Y | N | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | C | P | P | E | W | T | G | Q | Y | C | T | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|