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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5fj9M_ | PDB header: transcription | Chain: M: PDB Molecule: dna-directed rna polymerase iii subunit rpc5; | PDBTitle: cryo-em structure of yeast apo rna polymerase iii at 4.6 a |
Added to library: Sat Nov 28 08:22:50 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | E | F | P | L | K | I | S | G | E | E | E | S | L | H | V | F | Q | Y | A | N | R | P | R | L | V | G | R | K | P | A | E | H | P | F | I | S | A | A | R | Y | K | P | K | S | H | L | W | E | I | D | I | P | L | D | E | Q | A | F | Y | N | K | D | K | A | E | S | E | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | B | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | G | V | N | V | Q | T | L | K | G | V | G | V | E | N | N | G | Q | Y | A | A | F | V | K | D | M | Q | V | Y | L | V | P | I | E | R | V | A | Q | L | K | P | F | F | K | Y | I | D | D | A | N | V | T | R | K | Q | E | Q | N | R | L | T | G | S | L | L | A | H | K | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | E | E | A | N | I | E | L | T | W | A | E | G | T | F | E | Q | F | K | D | T | I | V | K | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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