|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5f3jD_ | 4.00 | PDB header: immune system | Chain: D: PDB Molecule: antibody 2d10 single chain variable fragment; |
Added to library: Sat May 21 09:09:35 2016 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | D | I | V | I | T | Q | D | E | L | S | N | P | V | T | S | G | E | S | V | S | I | S | C | R | S | S | K | S | L | L | Y | Q | D | G | K | T | Y | L | N | W | F | L | Q | R | P | G | Q | S | P | Q | L | L | I | Y | L | M | S | T | R | A | S | G | V | S | D | R | F | S | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | B | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | S | G | T | D | F | T | L | E | I | S | R | V | E | A | E | D | V | G | V | Y | Y | C | Q | Q | L | V | E | Y | P | L | T | F | G | A | G | T | K | L | E | L | K | R | Q | L | Q | Q | S | G | P | E | L | V | K | P | G | A | S | V | K | I | S | C | K | A | S | G | Y | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | B | B | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | S | S | W | M | N | W | V | K | Q | R | P | G | K | G | L | E | W | I | G | R | I | Y | P | G | D | G | D | T | H | Y | N | G | K | F | K | G | K | A | T | L | T | A | D | K | S | S | S | T | A | Y | M | Q | L | S | S | L | T | S | E | D | S | A | V | Y | F | C | A | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | T | A | Q | T | G | G | F | D | Y | W | G | Q | G | T | T | L | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|