|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5eyfA_ | PDB header: solute-binding protein | Chain: A: PDB Molecule: glutamate abc superfamily atp binding cassette transporter, | PDBTitle: crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium2 with bound glutamate |
Added to library: Sat Dec 19 08:46:12 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | E | D | I | L | E | R | S | K | S | T | N | E | I | I | W | G | V | K | Y | D | T | R | L | F | G | X | X | D | I | E | S | R | T | V | Q | G | F | D | V | D | I | A | K | A | I | T | K | K | I | L | G | D | N | G | K | T | E | F | V | E | V | T | S | K | T | R | I | P | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | N | G | N | I | D | A | I | I | A | T | X | T | I | T | D | E | R | K | K | Q | V | D | F | S | D | V | Y | F | D | A | G | Q | A | L | L | V | K | K | G | S | Q | I | K | S | V | D | D | L | N | A | S | T | T | V | L | A | V | K | G | S | T | S | A | A | N | I | R | Q | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | B | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | P | D | A | K | I | L | E | L | E | N | Y | A | E | A | F | T | A | L | Q | S | G | Q | G | D | A | X | T | T | D | N | A | I | L | L | G | I | A | D | E | N | P | E | Y | E | L | V | G | G | T | F | T | N | E | P | Y | G | I | A | I | N | K | G | Q | E | N | F | L | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | |||||||||||||||||||
Sequence | V | N | Q | A | L | E | E | X | H | A | D | G | T | Y | D | K | I | Y | Q | K | W | F | P | N | E | T | E | G | K | V | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|