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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ex2A_ | 1.29 | PDB header: isomerase | Chain: A: PDB Molecule: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; |
Added to library: Sat Jun 25 08:22:28 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | E | Y | T | K | E | S | V | Q | A | D | P | E | N | W | R | S | V | D | P | D | N | L | V | I | F | E | T | T | K | G | V | V | Y | I | E | L | A | P | E | I | A | P | N | H | V | A | Q | I | R | K | V | V | R | T | G | L | Y | S | G | T | K | F | H | R | V | I | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | M | A | Q | G | G | D | I | A | A | T | L | G | R | E | P | D | L | E | A | V | D | G | E | F | V | F | R | R | D | P | K | S | I | V | L | T | V | I | N | E | E | D | Q | T | K | S | Q | Y | T | G | F | Y | N | G | F | P | I | E | T | R | Q | D | E | L | A | N | Y | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | B | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | K | R | V | E | S | W | M | P | H | C | A | G | V | V | S | M | A | R | T | N | D | P | N | S | G | K | D | Q | F | F | L | M | R | D | E | S | R | F | L | D | R | K | Y | S | S | W | G | R | M | L | E | G | L | D | V | A | K | S | L | T | I | G | E | P | P | E | R | P | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | T | T | B | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | I | L | V | S | A | V | M | V | S | D | L | A | P | K | D | R | P | E | A | W | V | M | R | N | D | G | P | M | F | S | L | F | L | D | R | M | G | R | D | K | D | V | C | S | L | P | Q | T | P | S | V | V | F | V | S | E | D | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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