|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5ewnA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: structural protein; | PDBTitle: crystal structure of the human astrovirus 1 capsid protein core domain2 at 2.6 a resolution |
Added to library: Sat Dec 26 08:14:02 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | I | C | Q | R | A | T | A | T | L | G | T | V | G | S | N | T | S | G | T | T | E | I | E | A | C | I | L | L | N | P | V | L | V | K | D | A | T | G | S | T | Q | F | G | P | V | Q | A | L | G | A | Q | Y | S | M | W | K | L | K | Y | L | N | V | K | L | T | S | M | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | S | A | V | N | G | T | V | L | R | V | S | L | N | P | T | S | T | P | S | S | T | S | W | S | G | L | G | A | R | K | H | L | D | V | T | V | G | K | N | A | T | F | K | L | K | P | S | D | L | G | G | P | R | D | G | W | W | L | T | N | T | N | D | N | A | S | D | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | B | T | B | T | B | B | T | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | P | S | I | E | I | H | T | L | G | R | T | M | S | S | Y | K | N | E | Q | F | T | G | G | L | F | L | V | E | L | A | S | E | W | C | F | T | G | Y | A | A | N | P | N | L | V | N | L | V | K | S | T | D | N | Q | V | P | V | T | F | E | G | S | A | G | S | P | L | I | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | G | G | G | G | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | V | S | E | G | S | H | F | A | R | T | V | L | A | R | S | T | T | P | T | T | L | A | G | E | R | T | T | S | D | T | V | W | Q | V | L | N | T | A | V | S | A | A | E | L | V | T | P | P | P | F | N | W | L | V | K | G | G | W | W | F | V | K | L | I | A | G | R | T | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | S | B | S | S | G | G | G | G | G | T | T | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | |||||
Sequence | T | G | S | R | S | F | Y | V | Y | P | S | Y | Q | D | A | L | S | N | K | P | A | L | C | T | G | S | T | P | V | T | T | T | L | Q | F | T | Q | M | N | Q | P | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|