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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5eo6A_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: coproporphyrinogen oxidase; | PDBTitle: coproporphyrinogen iii oxidase (hemf) from acinetobacter baumannii |
Added to library: Sat Dec 5 08:15:54 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | H | P | T | S | T | D | I | Q | R | V | R | E | F | L | L | D | L | Q | A | R | I | C | A | G | L | E | Q | Q | E | K | A | G | G | G | T | A | E | F | I | I | D | D | W | E | R | P | E | G | G | G | G | R | S | R | V | L | Q | N | G | T | V | I | E | K | G | G | V | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | S | H | I | N | I | S | K | L | P | A | S | A | T | E | R | H | P | Q | I | A | G | A | K | A | Q | A | L | G | V | S | L | V | I | H | P | K | N | P | N | I | P | T | S | H | A | N | V | R | L | F | V | A | E | R | E | D | Q | D | P | I | W | W | F | G | G | G | F | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | P | F | Y | P | D | D | Q | D | V | L | N | W | H | Q | A | A | Y | D | L | C | K | P | F | G | D | N | V | Y | A | E | H | K | K | W | C | D | D | Y | F | Y | L | K | H | R | D | E | Q | R | G | V | G | G | L | F | F | D | D | L | N | C | W | D | F | E | T | C | F | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | Q | A | V | G | N | G | Y | L | N | A | I | L | P | I | F | E | K | H | R | E | Q | P | Y | T | E | A | Q | R | E | F | Q | L | Y | R | R | G | R | Y | V | E | Y | N | L | V | Y | D | R | G | T | L | F | G | L | Q | T | G | G | R | I | E | S | I | L | V | S | L | P | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | A | W | S | Y | R | P | E | W | D | E | D | S | P | E | K | R | L | T | D | Y | Y | L | K | P | R | D | W | L | G | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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