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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ed8A_ | 2.50 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: mkiaa0668 protein; |
Added to library: Sat Jan 16 08:36:02 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | S | G | L | L | Q | R | D | E | M | H | A | Q | L | Q | E | L | E | N | K | I | L | T | K | M | A | E | M | Q | G | K | S | A | R | E | A | A | A | S | L | G | Q | I | L | Q | K | E | G | I | V | G | V | T | E | E | Q | V | H | R | I | V | K | Q | A | L | Q | R | Y | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | R | I | G | M | V | D | Y | A | L | E | S | G | G | A | S | V | I | S | T | R | C | S | E | T | Y | E | T | K | T | A | L | L | S | L | F | G | I | P | L | W | Y | H | S | Q | S | P | R | V | I | L | Q | P | D | V | H | P | G | N | C | W | A | F | Q | G | P | Q | G | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | T | G | G | G | S | B | T | T | S | B | G | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | V | R | L | S | A | R | I | R | P | T | A | V | T | L | E | H | V | P | K | A | L | S | P | N | S | T | I | S | S | A | P | K | D | F | A | I | F | G | F | D | E | D | L | Q | Q | E | G | T | L | L | G | T | F | A | Y | D | Q | D | G | E | P | I | Q | T | F | Y | F | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | G | G | G | T | T | S | B | S | S | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | S | K | M | A | T | Y | Q | V | V | E | L | R | I | L | T | N | W | G | H | P | E | Y | T | C | I | Y | R | F | R | V | H | G | E | P | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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