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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5e7tB_ | 2.90 | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: minor structural protein 5; |
Added to library: Sat Jan 2 08:13:16 2016 | |
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Sequence | M | A | D | K | N | Y | L | H | T | A | Y | A | N | S | A | D | G | T | D | G | F | T | T | V | Y | P | N | L | N | L | L | V | N | S | S | A | K | N | K | E | G | F | F | K | N | F | D | K | V | E | N | G | Y | G | E | V | T | M | K | G | T | N | A | W | V | N | K | D | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | B | S | S | B | B | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | G | F | S | I | Q | P | I | N | Y | K | P | G | D | K | Y | T | M | S | V | D | V | M | F | T | S | W | N | V | P | A | G | T | T | I | S | A | F | W | M | R | Q | R | Y | T | E | N | S | W | K | E | I | C | T | I | D | L | P | K | D | P | S | K | M | L | N | Q | W | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | B | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | T | Q | T | S | T | I | P | P | Y | E | D | P | S | V | G | T | Q | A | I | L | N | V | G | F | F | G | Q | Q | E | G | S | F | T | I | R | V | R | N | P | K | Q | E | L | G | S | I | A | T | P | Y | M | P | S | A | S | E | V | T | T | A | D | W | P | K | F | V | G | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | D | T | N | P | V | S | S | T | V | S | S | K | Y | D | W | D | E | M | K | Y | R | V | Y | L | D | G | T | P | V | G | G | S | K | L | L | S | F | D | L | E | N | L | K | A | G | T | S | Y | N | V | Q | V | S | Q | I | N | G | N | V | E | S | D | K | S | E | S | V | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | T | T | B | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | T | T | L | P | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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