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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5e37A_ | 1.60 | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: ef-hand domain-containing thioredoxin; |
Added to library: Sat Jun 25 08:28:27 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | M | D | D | A | S | K | A | K | M | E | E | L | E | R | R | F | K | M | A | D | V | D | G | N | G | H | I | D | R | E | E | L | R | N | L | L | E | S | M | E | S | G | E | V | Y | M | M | S | Q | H | W | L | P | E | D | E | L | E | R | C | M | E | Q | Y | D | V | N | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | B | B | T | T | T | T | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | V | I | S | F | E | E | F | K | Q | I | I | Y | D | G | L | L | L | E | G | T | L | A | E | Y | E | S | A | F | K | A | V | D | K | S | G | N | G | T | I | G | A | T | E | L | S | K | L | F | A | S | L | G | N | P | V | S | L | E | K | L | V | D | L | M | Q | M | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | S | S | T | T | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | D | D | S | G | Q | I | E | F | P | E | F | L | L | M | F | R | N | S | L | L | D | L | K | D | M | T | T | Y | M | T | L | G | S | S | G | S | L | V | D | A | V | E | G | D | M | T | L | I | F | S | E | E | E | L | D | A | L | I | S | A | N | P | D | K | L | V | V | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | A | L | T | W | C | R | P | C | K | G | M | Q | R | P | V | Q | K | L | A | E | H | Y | K | D | H | I | V | F | V | K | L | F | G | N | A | N | K | Q | T | K | R | I | F | K | E | R | F | Q | I | R | S | T | P | C | F | I | T | L | R | K | G | E | P | V | Y | T | Q | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | S | N | K | E | K | L | E | A | G | L | R | S | L | I | A | N | P | P | V | G | M | I | Y | P | S | A | E | A | L | A | A | L | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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