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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5dx9A_ | 2.15 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: trehalose-6-phosphate phosphatase; |
Added to library: Sat Jun 18 08:20:07 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | T | P | A | L | D | T | A | Q | F | T | D | A | Y | K | K | A | N | K | R | L | L | L | F | N | Y | D | G | T | L | T | P | I | V | K | V | P | S | H | A | V | P | T | E | R | T | R | N | A | I | A | A | L | C | K | D | P | K | N | V | V | Y | L | I | S | G | R | D | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | B | T | T | T | B | S | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | L | E | E | H | W | G | H | L | D | R | L | G | L | S | A | E | H | G | S | F | V | K | Q | P | G | E | E | D | F | I | N | X | T | E | A | L | D | X | S | W | X | S | E | V | E | E | I | F | K | Y | Y | T | E | R | T | T | G | S | T | I | E | V | K | K | A | S | I | T | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | Y | R | N | S | D | P | D | F | G | E | F | Q | C | K | Q | A | L | D | L | L | E | S | S | L | A | P | R | R | P | I | E | V | L | V | G | K | K | N | L | E | V | R | P | L | A | V | N | K | G | E | I | V | R | R | L | X | Y | E | N | P | D | V | D | L | I | F | C | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | D | K | T | D | E | D | X | F | R | A | L | R | T | I | F | P | P | G | G | V | V | D | N | N | P | V | V | X | K | P | P | V | A | V | T | S | A | L | E | P | E | E | V | A | E | L | P | D | V | E | L | T | I | R | S | K | G | V | F | A | T | T | V | G | P | P | A | K | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | T | L | A | G | W | H | V | T | C | P | E | E | V | V | E | A | F | E | S | L | L | E | E | I | Q | V | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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