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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5dh0B_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: siderophore periplasmic binding protein; | PDBTitle: structure of the siderophore periplasmic binding protein from the2 fuscachelin gene cluster of thermobifida fusca in p41 |
Added to library: Sat Nov 21 08:30:55 2015 | |
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Sequence | H | H | H | H | H | S | E | I | P | A | D | P | Q | R | I | V | A | L | E | F | G | T | E | V | V | L | E | A | G | I | E | P | V | G | V | I | E | P | V | A | T | L | Y | T | A | E | E | F | E | Q | L | S | T | Y | P | V | V | Q | S | A | S | L | E | I | N | M | E | A | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | A | Q | P | D | L | I | I | G | G | V | R | V | E | S | H | D | E | Y | V | G | I | R | E | D | L | E | K | I | A | P | T | V | F | F | D | F | D | G | A | G | S | G | L | R | N | M | T | L | E | L | S | R | V | V | G | D | G | E | R | A | E | A | E | Q | Q | R | F | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | S | S | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | V | E | E | I | S | T | A | Y | A | D | Q | L | A | D | T | T | F | A | L | V | F | G | V | D | G | E | F | A | V | V | N | T | N | A | W | G | G | E | I | L | H | T | L | G | A | K | Q | S | K | A | Q | Q | P | A | G | E | N | F | A | A | F | Y | S | Y | E | E | I | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | B | T | T | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | S | D | A | D | V | I | F | Y | E | T | D | A | Q | E | N | P | D | P | F | T | E | A | L | L | E | Q | K | L | W | Q | S | L | P | A | V | E | A | G | Q | V | H | P | L | R | Y | S | A | A | R | T | Y | A | Q | A | N | I | V | L | D | Q | I | E | E | V | L | K | G | L | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | S | T | T | S | T | T | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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