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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5dfwH_ | PDB header: cell adhesion | Chain: H: PDB Molecule: single chain fv fragment; | PDBTitle: crystal structure of human cd81 large extracellular loop in complex2 with single chain fv fragment k13 |
Added to library: Sat Dec 19 08:54:50 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | R | L | H | Q | S | A | A | Q | L | V | Q | P | G | A | S | V | R | L | S | C | T | T | S | G | F | N | F | K | D | S | Y | L | H | W | V | K | Q | R | P | A | Q | G | L | E | W | I | G | R | I | D | T | G | N | G | N | V | K | F | D | P | K | F | Q | D | K | A | T | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | D | I | P | S | M | T | A | Y | L | H | L | S | N | L | T | S | E | D | T | A | V | Y | Y | C | V | P | Y | G | Y | G | F | H | S | W | G | D | G | T | T | L | T | V | S | S | D | I | Q | M | T | Q | S | P | A | S | L | S | V | S | V | G | E | T | V | T | I | T | C | R | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | E | N | I | Y | R | T | L | A | W | Y | L | Q | K | Q | G | K | S | P | Q | L | L | V | Y | G | A | T | T | L | A | D | G | V | P | S | R | F | S | G | S | G | S | G | T | Q | Y | Y | L | K | I | N | S | L | Q | S | E | D | F | G | T | Y | H | C | Q | H | F | W | G | T | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | W | T | F | G | G | G | T | K | V | E | I | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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