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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5dcxK_ | PDB header: dna binding protein | Chain: K: PDB Molecule: protein rep68; | PDBTitle: structural studies of aav2 rep68 reveal a partially structured linker2 and compact domain conformation |
Added to library: Sat Sep 26 08:25:56 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | P | G | F | Y | E | I | V | I | K | V | P | S | D | L | D | G | H | L | P | G | I | S | D | S | F | V | N | W | V | A | E | K | E | W | E | L | P | P | D | S | D | M | D | L | N | L | I | E | Q | A | P | L | T | V | A | E | K | L | Q | R | D | F | L | T | E | W | R | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | K | A | P | E | A | L | F | F | V | Q | F | E | K | G | E | S | Y | F | H | M | H | V | L | V | E | T | T | G | V | K | S | M | V | L | G | R | F | L | S | Q | I | R | E | K | L | I | Q | R | I | Y | R | G | I | E | P | T | L | P | N | W | F | A | V | T | K | T | G | N | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | V | V | D | E | S | Y | I | P | N | Y | L | L | P | K | T | Q | P | E | L | Q | W | A | W | T | N | M | E | Q | Y | L | S | A | C | L | N | L | T | E | R | K | R | L | V | A | Q | H | L | T | H | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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