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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5cwvB_ | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: nucleoporin nup192; | PDBTitle: crystal structure of chaetomium thermophilum nup192 tail domain |
Added to library: Sat Sep 19 08:14:33 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | G | D | K | L | F | Q | L | F | Q | L | C | L | S | A | I | S | Q | C | S | G | T | P | E | L | R | S | L | Y | Y | S | I | C | Y | R | Y | L | T | A | V | V | S | V | T | N | A | R | A | R | T | L | K | A | I | T | L | Y | G | D | R | L | L | N | V | I | C | D | D | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | S | D | T | T | C | Q | T | A | A | X | I | L | L | N | A | L | V | H | T | S | R | A | S | S | D | V | D | C | P | I | I | D | A | L | N | R | L | N | F | I | G | V | L | V | D | S | L | K | E | I | L | N | E | W | L | A | A | S | P | S | Q | Q | Y | T | S | A | K | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | L | Q | L | C | Q | T | R | Q | G | A | K | Y | V | L | Q | A | N | L | F | R | A | L | E | Q | S | G | V | F | A | A | D | P | E | L | S | G | V | P | R | V | V | A | L | E | R | H | Y | A | L | L | V | A | L | A | R | V | V | G | A | A | V | T | A | R | G | A | H | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . |
Sequence | I | V | Q | G | R | K | F | L | T | Q | H | R | G | L | V | V | H | V | L | K | K | R | D | E | I | L | A | Q | Q | A | L | E | E | R | I | E | E | L | A | E | A | F | X | L | L | I | T | A | T | G | F | L | E | Y | E | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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