|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5cvoB_ | PDB header: hydrolase/protein binding | Chain: B: PDB Molecule: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46; | PDBTitle: wdr48:usp46~ubiquitin ternary complex |
Added to library: Sat Oct 10 08:40:39 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | N | E | H | Y | F | G | L | V | N | F | G | N | T | C | Y | C | N | S | V | L | Q | A | L | Y | F | C | R | P | F | R | E | N | V | L | A | Y | K | A | Q | Q | K | K | K | E | N | L | L | T | C | L | A | D | L | F | H | S | I | A | T | Q | K | K | K | V | G | V | I | P | P | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | F | I | S | R | L | R | K | E | N | D | L | F | D | N | Y | M | Q | Q | D | A | H | E | F | L | N | Y | L | L | N | T | I | A | D | I | L | Q | E | E | K | K | Q | E | K | Q | N | K | P | E | L | T | W | V | H | E | I | F | Q | G | T | L | T | N | E | T | R | C | L | N | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | T | V | S | S | K | D | E | D | F | L | D | L | S | V | D | V | E | Q | N | T | S | I | T | H | C | L | R | D | F | S | N | T | E | T | L | C | S | E | Q | K | Y | Y | C | E | T | C | C | S | K | Q | E | A | Q | K | R | M | R | V | K | K | L | P | M | I | L | A | L | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | R | F | K | Y | M | E | Q | L | H | R | Y | T | K | L | S | Y | R | V | V | F | P | L | E | L | R | L | F | N | T | S | S | D | A | V | N | L | D | R | M | Y | D | L | V | A | V | V | V | H | C | G | S | G | P | N | R | G | H | Y | I | T | I | V | K | S | H | G | F | W | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | ||||||||||
Sequence | L | F | D | D | D | I | V | E | K | I | D | A | Q | A | I | E | E | F | Y | G | L | T | S | D | I | S | K | N | S | E | S | G | Y | I | L | F | Y | Q | S | R | E | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|