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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5cuwA_ | 1.89 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: srte1; |
Added to library: Thu Feb 9 17:43:45 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | Q | A | P | G | Q | G | F | A | L | L | H | I | P | K | L | D | V | V | V | P | I | A | E | G | I | S | S | K | K | V | L | D | R | G | M | V | G | H | Y | A | E | D | G | L | K | T | A | M | P | D | A | K | A | G | N | F | G | L | A | G | H | R | N | T | H | G | E | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | Y | I | N | K | L | E | P | G | D | P | I | V | V | E | T | Q | D | K | Y | F | V | Y | K | M | A | S | I | L | P | V | T | S | P | S | N | V | S | V | L | D | P | V | P | K | Q | S | G | F | K | G | P | G | R | Y | I | T | L | T | T | C | T | P | E | F | T | S | K | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | T | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | M | I | V | W | G | K | M | V | E | E | R | P | R | S | K | G | K | P | D | A | L | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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