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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5cozA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of an uncharacterized protein (eubrec_2869) from2 eubacterium rectale atcc 33656 at 1.45 a resolution |
Added to library: Sat Aug 8 08:26:23 2015 | |
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Sequence | D | L | N | D | Y | E | N | V | L | N | S | L | D | E | E | Q | I | G | K | L | P | Q | N | I | K | C | V | V | N | D | K | L | N | I | D | S | E | I | N | I | W | D | A | T | S | Y | Y | V | K | S | G | K | V | K | A | I | N | F | S | E | N | K | D | K | C | Y | D | L | X | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | A | K | A | I | N | L | N | K | D | V | C | V | Q | S | H | R | S | E | N | G | N | E | I | Y | L | W | D | N | N | Y | T | Q | D | S | I | A | I | R | N | D | S | A | L | A | E | T | H | D | G | K | L | A | V | S | A | S | K | F | G | T | Y | Y | S | P | F | N | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | S | S | B | S | T | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | K | F | R | T | D | K | Q | L | X | F | X | S | A | E | E | A | E | E | L | A | V | K | T | A | K | E | L | E | I | N | V | C | E | K | N | E | L | Y | V | L | D | D | K | N | T | L | I | F | P | E | D | D | T | D | K | Q | N | D | T | Y | V | F | F | X | F | P | D | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T | S | B | S | S | S | T | T | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | I | P | Y | S | R | C | P | E | N | E | A | L | T | G | Y | A | N | Q | E | N | H | L | V | I | A | X | D | E | K | G | I | S | F | L | D | I | P | P | L | Y | D | W | V | E | T | T | E | T | G | E | I | L | H | P | S | S | I | L | S | K | E | V | D | K | L | K | K | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | T | T | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | S | G | D | I | E | V | S | E | I | S | L | E | Y | X | L | F | A | D | K | N | E | T | Y | D | I | K | P | V | W | V | V | Y | Y | Y | Q | N | Q | L | V | T | G | E | N | S | Y | T | Q | K | X | A | L | Y | D | V | Y | D | A | Y | T | G | E | E | Y | R | I | Q | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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