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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5cf3A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: bone sialoprotein-binding protein; | PDBTitle: crystal structures of bbp from staphylococcus aureus |
Added to library: Sat Sep 26 08:30:58 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | N | N | V | N | D | L | I | T | V | T | K | Q | M | I | T | E | G | I | K | D | D | G | V | I | Q | A | H | D | G | E | H | I | I | Y | T | S | D | F | K | I | D | N | A | V | K | A | G | D | T | M | T | V | K | Y | D | K | H | T | I | P | S | D | I | T | D | D | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | V | D | I | T | D | P | S | G | E | V | I | A | K | G | T | F | D | L | N | T | K | T | I | T | Y | K | F | T | D | Y | V | D | R | Y | E | N | V | N | A | K | L | E | L | N | S | Y | I | D | K | K | E | V | P | N | E | T | N | L | N | L | T | F | A | T | A | D | K | E | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | K | N | V | K | V | E | Y | Q | K | P | I | V | K | D | E | S | N | I | Q | S | I | F | S | H | L | D | T | T | K | H | E | V | E | Q | T | I | Y | V | N | P | L | K | L | N | A | K | N | T | N | V | T | I | K | S | G | G | V | A | D | N | G | D | Y | Y | T | G | D | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | I | I | D | S | N | T | E | I | K | V | Y | K | V | A | S | G | Q | Q | L | P | Q | S | N | K | I | Y | D | Y | S | Q | Y | E | D | V | T | N | S | V | T | I | N | K | N | Y | G | T | N | M | A | N | I | N | F | G | D | I | D | S | A | Y | I | V | K | V | V | S | K | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | P | G | A | E | D | D | L | A | V | Q | Q | G | V | R | M | T | T | T | N | K | Y | N | Y | S | S | Y | A | G | Y | T | N | T | I | L | S | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S |
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