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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5cdcC_ | 4.00 | PDB header: virus | Chain: C: PDB Molecule: vp3, structural polyprotein; |
Added to library: Sat Jul 9 08:43:17 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | L | A | S | S | T | S | E | N | S | V | E | T | Q | E | I | T | T | F | H | D | V | E | T | P | N | R | I | D | T | P | M | A | Q | D | T | S | S | A | R | N | M | D | D | T | H | S | I | I | Q | F | L | Q | R | P | V | L | I | D | N | I | E | I | I | A | G | T | T | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G | G | S | B | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | N | K | P | L | S | R | Y | V | L | D | Q | Q | N | S | Q | K | Y | V | R | S | W | T | L | P | S | T | V | L | K | A | G | G | K | A | Q | K | L | A | N | F | K | Y | L | R | C | D | V | Q | V | K | L | V | L | N | A | N | P | F | V | A | G | R | M | Y | L | A | Y | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S | T | T | B | B | B | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | D | D | K | V | D | T | A | R | S | V | L | Q | T | S | R | A | G | V | T | G | Y | P | G | V | E | L | D | F | Q | L | D | N | S | V | E | M | T | I | P | Y | A | S | F | Q | E | A | Y | D | L | V | T | G | T | E | D | F | V | Q | L | Y | L | F | P | I | T | P | V | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | G | G | G | S | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | |||
Sequence | P | K | S | E | S | E | S | S | K | V | D | I | S | V | Y | M | W | L | S | N | I | S | L | V | I | P | T | Y | R | M | N | P | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | B | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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