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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ca5A_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: nono-1; | PDBTitle: structure of the c. elegans nono-1 homodimer |
Added to library: Sat Dec 12 08:30:26 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | P | K | K | K | F | T | G | R | C | R | L | F | V | G | N | L | P | N | E | V | K | E | T | E | L | K | E | L | F | S | P | H | G | D | I | A | E | C | Y | L | S | G | K | G | F | A | F | L | R | L | D | T | R | A | H | A | E | S | A | K | E | A | I | D | G | R | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | G | R | Q | V | R | V | R | F | A | V | H | G | A | A | I | R | V | K | E | L | S | P | T | V | S | N | E | M | L | Y | H | A | F | S | H | F | G | D | V | E | R | A | V | H | I | V | D | E | K | G | R | P | T | G | E | G | I | V | E | F | E | R | K | P | N | C | N | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | A | A | I | R | D | K | V | F | L | L | T | A | S | P | K | P | L | I | C | E | V | L | E | P | R | D | E | D | D | G | L | A | E | R | M | I | P | R | T | P | G | L | S | K | E | R | E | L | G | P | R | F | P | T | P | N | S | F | E | Y | V | Y | G | M | K | W | K | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | Y | V | V | E | Q | K | R | R | A | Q | L | D | E | E | L | R | E | S | R | R | R | L | E | S | D | M | E | L | A | Y | Q | D | Y | Q | A | Q | M | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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