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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5c9eA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: sepl; | PDBTitle: sepl |
Added to library: Sat Oct 17 08:23:39 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | I | E | K | L | L | N | E | M | Q | E | L | L | T | L | T | D | S | D | K | I | K | E | L | S | L | K | N | S | G | L | L | E | D | P | T | L | A | M | F | G | N | M | P | K | G | E | I | V | A | L | I | S | S | L | L | Q | S | K | F | V | K | I | E | L | K | K | K | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | L | L | D | L | L | G | E | D | D | W | E | L | A | L | L | S | W | L | G | V | G | E | L | N | Q | E | G | I | Q | K | I | K | K | L | Y | E | K | A | K | D | A | S | L | L | D | W | F | M | E | I | K | D | L | P | E | R | E | K | H | L | K | V | I | I | R | A | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | D | L | S | Y | M | S | S | F | E | D | K | V | R | T | S | S | I | I | S | D | L | C | R | I | I | I | F | L | S | L | N | N | Y | T | D | I | I | A | I | S | I | K | K | D | K | D | V | I | L | N | E | M | L | S | I | I | E | H | V | W | L | T | E | D | W | L | L | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | ||||||
Sequence | P | S | R | V | S | I | V | E | D | K | H | V | Y | Y | F | H | L | L | K | E | F | F | A | S | L | P | D | A | C | F | I | D | N | E | Q | R | S | N | T | L | L | M | I | G | K | V | I | D | Y | K | E | D | V | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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