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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5bvrA_ | 1.46 | PDB header: cell cycle | Chain: A: PDB Molecule: alpha-actinin-like protein 1; |
Added to library: Sat Mar 26 08:29:10 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | Q | S | V | Q | N | R | T | F | T | K | W | F | N | T | K | L | S | S | R | D | L | P | S | V | F | D | L | R | K | D | L | S | D | G | I | L | L | I | Q | L | L | E | I | I | G | D | E | N | L | G | R | Y | N | R | N | P | R | M | R | V | H | R | L | E | N | V | N | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | Y | I | K | S | K | G | M | P | L | T | N | I | G | P | A | D | I | V | D | G | N | L | K | L | I | L | G | L | I | W | T | L | I | L | R | F | T | I | A | D | I | N | E | E | G | L | T | A | K | E | G | L | L | L | W | C | Q | R | K | T | A | N | Y | H | P | E | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Q | D | F | T | R | S | W | T | N | G | L | A | F | C | A | L | I | H | Q | H | R | P | D | L | L | D | Y | N | K | L | D | K | K | N | H | R | A | N | M | Q | L | A | F | D | I | A | Q | K | S | I | G | I | P | R | L | I | E | V | E | D | V | C | D | V | D | R | P | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | S | I | M | T | Y | V | A | E | Y | F | H | A | F | S | T | L | D | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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