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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5bobA_ | PDB header: translation | Chain: A: PDB Molecule: translation initiation factor 2 (if-2 gtpase); | PDBTitle: crystal structure of the meningitis pathogen streptococcus suis2 adhesion fhb |
Added to library: Sat Nov 21 08:15:35 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | Q | S | P | L | I | Q | T | S | N | A | D | Y | K | S | G | K | D | Q | E | K | L | R | T | S | V | S | I | N | L | L | K | A | E | G | Q | I | Q | W | K | V | T | F | D | T | S | E | W | S | F | N | V | K | H | G | G | V | Y | F | I | L | P | N | G | L | D | L | T | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | G | G | G | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | N | N | Q | H | D | I | T | A | S | F | P | T | D | I | N | D | Y | R | N | S | G | Q | E | K | Y | R | F | F | S | S | K | Q | G | L | D | N | E | N | G | F | N | S | Q | W | N | W | S | A | G | Q | A | N | P | S | E | T | V | N | S | W | K | S | G | N | R | L | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | G | G | G | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | I | Y | F | I | N | Q | I | T | D | T | T | E | L | T | Y | T | L | T | A | K | V | T | E | P | N | Q | Q | S | F | P | L | L | A | V | X | K | S | F | T | Y | T | N | S | K | S | T | E | V | T | S | L | G | A | R | E | I | T | L | E | K | E | K | T | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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