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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5bo6B_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: sia-alpha-2,3-gal-beta-1,4-glcnac-r:alpha 2,8- | PDBTitle: structure of human sialyltransferase st8siaiii in complex with cdp |
Added to library: Sat Jul 18 08:22:20 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | K | F | N | R | T | A | F | L | H | Q | R | Q | E | I | L | Q | H | V | D | V | I | K | N | F | S | L | T | K | N | S | V | R | I | G | Q | L | M | H | Y | D | Y | S | S | H | K | Y | V | F | S | I | S | N | N | F | R | S | L | L | P | D | V | S | P | I | M | N | K | H | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | I | C | A | V | V | G | N | S | G | I | L | T | G | S | Q | C | G | Q | E | I | D | K | S | D | F | V | F | R | C | N | F | A | P | T | E | A | F | Q | R | D | V | G | R | K | T | N | L | T | T | F | N | P | S | I | L | E | K | Y | Y | N | N | L | L | T | I | Q | D | R | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | F | F | L | S | L | K | K | L | D | G | A | I | L | W | I | P | A | F | F | F | H | T | S | A | T | V | T | R | T | L | V | D | F | F | V | E | H | R | G | Q | L | K | V | Q | L | A | W | P | G | N | I | M | Q | H | V | N | R | Y | W | K | N | K | H | L | S | P | K | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | T | G | I | L | M | Y | T | L | A | S | A | I | C | E | E | I | H | L | Y | G | F | W | P | F | G | F | D | P | N | T | R | E | D | L | P | Y | H | Y | Y | D | Q | L | P | A | E | F | Q | L | L | Y | R | M | H | G | E | G | L | T | K | L | T | L | S | H | C | A | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | B | S | B | T | T | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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