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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5bmtB_ | PDB header: unknown function | Chain: B: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of an uncharacterized protein (parmer_03598) from2 parabacteroides merdae atcc 43184 at 1.50 a resolution |
Added to library: Sat Jun 13 08:22:59 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | L | S | S | Y | A | I | V | D | Y | S | S | T | X | R | T | L | I | Y | P | L | G | Y | Y | P | L | Y | V | A | T | I | A | N | D | P | T | Y | R | A | G | D | C | V | L | A | N | F | T | V | D | F | D | S | A | D | N | A | N | A | S | T | N | G | F | Y | V | A | T | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | S | S | P | L | A | K | Y | D | L | S | Y | S | P | L | D | S | X | A | L | D | N | E | L | L | L | S | G | S | E | S | A | L | L | F | S | N | N | Y | K | R | I | V | V | I | P | T | F | T | S | V | L | T | D | Q | K | N | T | Y | I | X | S | X | D | S | N | Q | E | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | V | D | G | T | D | R | V | Y | T | L | C | L | R | A | Q | K | R | E | E | G | K | A | P | T | I | S | N | A | X | D | P | I | A | V | E | G | G | T | L | Y | S | X | L | K | G | K | E | S | A | A | G | K | K | I | V | S | Y | R | V | K | Y | P | L | T | F | N | A | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | K | I | A | T | W | G | Y | S | K | I | S | Q | F | S | I | E | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | - |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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