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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5awtA_ | 2.70 | PDB header: endocytosis | Chain: A: PDB Molecule: sh3-containing grb2-like protein 3-interacting protein 1; |
Added to library: Sat Jul 9 08:24:55 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | T | L | P | V | A | A | A | F | T | E | T | V | N | A | Y | F | K | G | A | D | P | S | K | C | I | V | K | I | T | G | E | M | V | L | S | F | P | A | G | I | T | R | H | F | A | N | N | P | S | P | A | A | L | T | F | R | V | I | N | F | S | R | L | E | H | V | L | P | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | Q | L | L | C | C | D | A | N | T | K | E | F | W | V | N | M | P | N | L | M | T | H | L | K | K | V | S | E | Q | K | P | Q | A | T | Y | Y | N | V | D | M | L | K | Y | Q | V | S | A | Q | G | I | Q | S | T | P | L | N | L | A | V | N | W | R | C | E | P | S | S | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | I | D | Y | K | Y | N | T | D | A | M | T | T | A | V | A | L | N | N | V | Q | F | L | V | P | I | D | G | G | V | T | K | L | Q | A | V | L | P | P | A | V | W | N | A | E | Q | Q | R | I | L | W | K | I | P | D | I | S | Q | K | S | E | N | G | G | V | G | S | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | R | F | Q | L | S | E | G | P | S | K | P | S | P | L | V | V | Q | F | T | S | E | G | S | T | L | S | G | C | D | I | E | L | V | G | A | G | Y | R | F | S | L | I | K | K | R | F | A | A | G | K | Y | L | A | D | N | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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