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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5aooC_ | UNK | PDB header: virus | Chain: C: PDB Molecule: vp3; |
Added to library: Sat Mar 12 08:51:05 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | W | K | T | R | A | V | P | G | A | G | T | F | G | S | A | V | A | G | Q | E | L | P | L | C | G | V | R | A | Y | Y | P | P | N | A | Y | I | P | A | Q | V | R | D | W | L | E | F | A | H | R | P | G | L | M | A | T | V | P | W | T | M | A | D | E | P | A | E | R | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | F | P | V | S | P | S | A | I | A | G | T | G | A | P | I | S | Y | V | I | S | L | F | S | Q | W | R | G | E | L | A | A | H | L | L | F | T | G | S | A | Q | H | Y | G | R | L | V | V | C | Y | T | P | A | A | P | Q | P | P | S | T | M | Q | E | A | M | R | G | T | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | W | D | V | N | A | A | S | T | L | E | F | T | I | P | F | I | S | N | S | Y | W | K | T | V | D | V | N | N | P | D | A | L | L | S | T | T | G | Y | V | S | I | W | V | Q | N | P | L | V | G | P | H | T | A | P | A | S | A | L | V | Q | A | F | I | S | A | G | E | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | V | R | L | M | Q | N | P | A | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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