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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5anbI_ | PDB header: translation | Chain: I: PDB Molecule: eukaryotic translation initiation factor 6; | PDBTitle: mechanism of eif6 release from the nascent 60s ribosomal subunit |
Added to library: Sat Oct 24 14:29:49 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | A | T | R | L | Q | Y | E | N | S | C | D | V | G | V | F | L | K | L | T | N | K | Y | C | L | V | G | Q | C | G | S | K | Q | F | L | H | T | V | E | N | R | L | A | D | H | I | P | V | V | E | T | S | I | A | G | T | R | I | V | G | R | L | S | A | G | N | K | N | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | S | S | S | S | S | B | S | S | T | T | T | T | S | B | B | T | T | B | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | P | N | T | C | T | D | Q | E | L | Q | Q | I | R | N | S | L | P | D | D | V | V | V | Q | R | I | E | E | K | F | S | A | L | G | N | C | I | A | T | N | D | Y | V | A | L | V | H | P | D | I | D | R | E | T | E | E | I | I | A | D | V | L | G | V | E | V | F | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | V | S | G | N | V | L | V | G | T | Y | C | A | L | T | N | Q | G | A | L | V | H | P | M | T | S | I | A | D | Q | D | E | L | S | S | L | L | Q | V | P | L | V | A | G | T | V | N | R | G | N | E | C | V | A | A | G | C | V | V | N | D | W | T | A | I | V | G | A | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | S | B | T | T | T | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | A | T | E | I | S | V | I | E | S | I | F | A | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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