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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5aj3g_ | PDB header: ribosome | Chain: G: PDB Molecule: mitoribosomal protein us7m, mrps7; | PDBTitle: structure of the small subunit of the mammalian mitoribosome |
Added to library: Sat Apr 25 08:17:18 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | S | L | Q | E | L | K | T | V | F | P | H | G | L | P | P | R | F | A | M | Q | V | K | T | F | N | E | A | C | L | M | V | R | K | P | A | L | E | L | L | H | Y | L | K | N | T | N | F | A | H | P | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | Y | V | L | Y | G | E | K | G | T | G | K | T | L | S | L | C | H | I | L | H | F | C | A | K | Q | N | W | L | I | L | H | I | P | D | A | H | I | W | V | K | N | C | R | D | L | L | Q | S | N | Y | N | K | Q | R | F | D | Q | P | L | E | A | S | T | W | L | K | N | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | A | N | E | H | F | L | S | Q | I | K | V | Q | E | K | Y | V | W | N | K | R | E | S | T | E | K | G | R | P | L | G | E | V | V | E | Q | G | I | M | R | V | R | N | A | T | D | A | V | G | I | V | L | K | E | L | K | R | Q | S | S | L | G | I | F | H | L | L | V | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | G | V | N | A | L | W | G | R | T | T | L | K | R | E | D | K | S | P | I | A | P | E | E | L | A | L | I | H | N | L | R | K | M | V | K | N | D | W | Q | G | G | A | I | V | L | T | V | S | Q | T | G | S | L | F | K | P | R | N | A | Y | L | P | Q | E | L | L | G | K | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | S | B | S | T | T | B | T | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | G | F | D | A | L | D | P | F | I | P | I | L | V | S | N | Y | N | P | K | E | F | E | S | C | I | Q | Y | Y | L | E | N | N | W | L | Q | H | E | K | A | H | T | E | E | G | K | K | E | L | L | F | L | S | N | R | N | P | G | Q | L | E | R | L | C | A | Y | L | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | G | S | T | T | T |
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