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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ahvF_ | PDB header: clathrin-binding protein | Chain: F: PDB Molecule: anth domain of endocytic adaptor sla2; | PDBTitle: cryo-em structure of helical anth and enth tubules on pi(4,5)2 p2-containing membranes |
Added to library: Sat May 9 08:18:09 2015 | |
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Sequence | D | S | D | L | Q | K | A | L | K | K | A | C | S | V | E | E | T | A | P | K | R | K | H | V | R | A | C | I | V | Y | T | W | D | H | Q | S | S | K | A | V | F | T | T | L | K | T | L | P | L | A | N | D | E | V | Q | L | F | K | M | L | I | V | L | H | K | I | I | Q | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | P | S | A | L | A | E | A | I | R | D | R | D | W | I | R | S | L | G | R | V | H | S | G | G | S | S | Y | S | K | L | I | R | E | Y | V | R | Y | L | V | L | K | L | D | F | H | A | H | H | R | G | F | N | N | G | T | F | E | Y | E | E | Y | V | S | L | V | S | V | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | D | E | G | Y | E | T | I | L | D | L | M | S | L | Q | D | S | L | D | E | F | S | Q | I | I | F | A | S | I | Q | S | E | R | R | N | T | E | C | K | I | S | A | L | I | P | L | I | A | E | S | Y | G | I | Y | K | F | I | T | S | M | L | R | A | M | H | R | Q | L | N | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | E | G | D | A | A | L | Q | P | L | K | E | R | Y | E | L | Q | H | A | R | L | F | E | F | Y | A | D | C | S | S | V | K | Y | L | T | T | L | V | T | I | P | K | L | P | V | D | A | P | D | V | F | L | I | N | D | V | D | E | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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