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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5aciA_ | 1.75 | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: lytic polysaccharide monooxygenase; |
Added to library: Sat Mar 5 08:24:48 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | V | W | G | V | W | V | N | G | V | D | Q | G | D | G | R | N | I | Y | I | R | S | P | P | N | N | N | P | V | K | N | L | T | S | P | D | M | T | C | N | V | D | N | R | V | V | P | K | S | V | P | V | N | A | G | D | T | L | T | F | E | W | Y | H | N | T | R | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | B | S | S | B | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | I | A | S | S | H | H | G | P | I | A | V | Y | I | A | P | A | A | S | N | G | Q | G | N | V | W | V | K | L | F | E | D | A | Y | N | V | T | N | S | T | W | A | V | D | R | L | I | T | A | H | G | Q | H | S | V | V | V | P | H | V | A | P | G | D | Y | L | F | R | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S | B | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | I | I | A | L | H | E | A | D | S | L | Y | S | Q | N | P | I | R | G | A | Q | F | Y | I | S | C | A | Q | I | T | I | N | S | S | D | D | S | T | P | L | P | A | G | V | P | F | P | G | A | Y | T | D | S | T | P | G | I | Q | F | N | I | Y | T | T | P | A | T | S | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | A | P | P | P | S | V | W | S | G | A | L | G | G | S | I | A | Q | V | G | D | A | S | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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