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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5aca3_ | PDB header: virus | Chain: 3: PDB Molecule: vp3; | PDBTitle: structure-based energetics of protein interfaces guide2 foot-and-mouth disease virus vaccine design |
Added to library: Sat Sep 26 08:42:33 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | I | I | P | V | A | C | F | D | G | Y | G | G | F | Q | N | T | D | P | K | T | A | D | P | I | Y | G | Y | V | Y | N | P | S | R | N | D | C | H | G | R | Y | S | N | L | L | D | V | A | E | A | C | P | T | F | L | N | F | D | G | K | P | Y | V | V | T | K | N | N | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | V | M | T | C | F | D | V | A | F | T | H | K | V | H | K | N | T | F | L | A | G | L | A | D | Y | Y | A | Q | Y | Q | G | S | L | N | Y | H | F | M | Y | T | G | P | T | H | H | K | A | K | F | M | V | A | Y | I | P | P | G | I | E | T | D | R | L | P | K | T | P | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | A | H | C | Y | H | S | E | W | D | T | G | L | N | S | Q | F | T | F | A | V | P | Y | V | S | A | S | D | F | S | Y | T | H | T | D | T | P | A | M | A | T | T | N | G | W | V | A | V | F | Q | V | T | D | T | H | S | A | E | A | A | V | V | V | S | V | S | A | G | P | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | E | F | R | F | P | V | D | P | V | R | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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