|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5a9cA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: polyhedrin; | PDBTitle: crystal structure of antheraea mylitta cpv4 polyhedra base2 domain deleted mutant |
Added to library: Sat Sep 5 08:19:03 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | R | D | V | R | R | E | Q | Q | E | I | I | T | R | Q | I | N | T | A | P | Y | V | Q | D | A | M | M | R | V | V | V | F | A | Q | Y | P | S | G | R | Y | K | A | F | D | Y | V | F | P | D | Y | L | K | V | F | L | N | W | R | E | L | L | E | G | S | G | R | Y | P | M | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | V | S | F | N | G | N | I | D | W | T | R | A | R | V | E | A | T | N | M | H | G | L | N | N | T | D | W | R | E | A | R | A | W | G | P | H | V | I | C | G | N | Q | L | R | K | A | G | H | L | S | R | A | V | Y | V | P | L | D | E | H | N | T | V | K | V | L | A | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | B | G | G | G | S | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | R | Q | N | R | F | N | G | P | Q | L | A | Q | T | L | T | N | N | I | V | C | P | N | V | I | E | F | N | T | E | S | D | V | I | D | Y | A | K | M | A | H | I | A | Y | I | D | Q | A | G | L | I | V | A | S | S | D | A | Y | I | S | G | D | S | Q | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|