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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a9aA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: polyhedrin; | PDBTitle: crystal structure of simulium ubiquitum cpv20 polyhedra |
Added to library: Sat Sep 5 08:21:19 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | Q | P | F | N | Q | P | N | V | L | Q | E | R | Q | H | L | V | N | R | Q | L | V | Q | G | P | N | V | Q | D | A | I | K | R | V | A | I | I | F | I | Y | K | N | G | S | Y | R | L | I | D | Y | N | A | P | E | F | I | N | G | Y | F | N | W | R | D | M | L | Y | M | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | S | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | P | A | H | S | N | R | H | K | E | F | E | N | Q | I | R | R | P | D | H | G | D | S | H | H | P | E | L | F | E | Y | P | V | A | I | M | I | S | A | N | G | N | I | C | W | E | N | V | R | V | E | V | E | N | E | D | C | L | N | H | E | D | W | R | R | A | R | A | W | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | B | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | R | C | Y | K | G | S | Q | M | M | K | C | S | A | L | G | R | F | L | Y | I | P | L | R | C | Q | N | E | S | L | K | F | K | F | P | S | R | M | S | G | G | D | N | R | Y | S | S | H | S | I | G | Q | V | I | Q | N | N | I | I | I | R | N | N | P | L | Y | L | D | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | B | B | T | T | B | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | |||||||||||||
Sequence | G | D | L | I | D | Y | M | Q | A | K | N | L | C | Y | I | D | S | A | A | V | V | D | C | N | G | L | A | G | D | S | E | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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