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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a8vA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: polyhedrin; | PDBTitle: crystal structure of orgyia pseudotsugata cpv5 polyhedra2 with semet substitution |
Added to library: Sat Sep 5 08:19:40 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | G | L | D | D | A | Q | Y | L | Q | Q | K | A | H | N | K | R | I | S | E | F | R | S | S | S | N | S | G | I | N | V | T | V | V | L | K | Y | T | N | G | V | V | Q | V | Y | N | W | Q | G | T | E | V | I | A | G | S | L | N | R | Q | L | X | K | F | P | N | Y | X | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | K | H | G | R | I | E | W | P | G | E | G | V | E | H | Q | H | G | L | I | R | S | N | G | G | N | G | S | Y | D | I | G | A | G | D | P | Y | A | X | Q | F | I | V | Q | G | S | V | D | W | N | A | T | R | L | R | F | F | G | P | D | G | S | R | W | X | P | D | D | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | S | V | R | A | G | L | L | N | A | A | E | D | I | I | N | S | K | X | Q | P | L | Y | F | C | D | R | X | A | G | K | S | Y | Y | V | R | F | D | D | K | Y | A | P | R | F | P | T | I | G | F | E | V | Y | R | Y | R | V | G | A | T | N | E | X | G | G | E | S | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | B | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . |
Sequence | T | A | V | A | S | L | I | S | F | P | T | F | S | T | A | Y | V | N | E | K | V | A | V | E | N | F | F | Q | P | R | E | L | V | Y | Q | N | S | Y | G | Y | T | V | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | B | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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