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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a5tF_ | PDB header: hydrolase | Chain: F: PDB Molecule: eukaryotic translation initiation factor 3 subunit f; | PDBTitle: structure of mammalian eif3 in the context of the 43s2 preinitiation complex |
Added to library: Sat Sep 12 08:19:42 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | P | G | G | R | V | V | R | L | H | P | V | I | L | A | S | I | V | D | S | Y | E | R | R | N | E | G | A | A | R | V | I | G | T | L | L | G | T | V | D | K | H | S | V | E | V | T | N | C | F | S | V | P | H | N | E | S | E | D | E | V | A | V | D | M | E | F | A | K | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | Y | E | L | H | K | K | V | S | P | N | E | L | I | L | G | W | Y | A | T | G | H | D | I | T | E | H | S | V | L | I | H | E | Y | Y | S | R | E | A | P | N | P | I | H | L | T | V | D | T | S | L | Q | N | G | R | M | S | I | K | A | Y | V | S | T | S | M | G | V | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | T | M | G | V | M | F | T | P | L | T | V | K | Y | A | Y | Y | D | T | E | R | I | G | V | D | L | I | M | K | T | C | F | S | P | N | R | V | I | G | L | S | S | D | L | Q | Q | V | G | G | A | S | A | R | I | Q | D | A | L | S | T | V | L | Q | Y | A | E | D | V | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | G | K | V | S | A | D | N | T | V | G | R | F | L | M | S | L | V | N | Q | V | P | K | I | V | P | D | D | F | E | T | M | L | N | S | N | I | N | D | L | L | M | V | T | Y | L | A | N | L | T | Q | S | Q | I | A | L | N | E | K | L | V | N | L | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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