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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a2fA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: cd166 antigen; | PDBTitle: two membrane distal igsf domains of cd166 |
Added to library: Sat Jul 25 08:39:23 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | Y | T | V | N | S | A | Y | G | D | T | I | I | I | P | C | R | L | D | V | P | Q | N | L | M | F | G | K | W | K | Y | E | K | P | D | G | S | P | V | F | I | A | F | R | S | S | T | K | K | S | V | Q | Y | D | D | V | P | E | Y | K | D | R | L | N | L | S | E | N | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | I | S | N | A | R | I | S | D | E | K | R | F | V | C | M | L | V | T | E | D | N | V | F | E | A | P | T | I | V | K | V | F | K | Q | P | S | K | P | E | I | V | S | K | A | L | F | L | E | T | E | Q | L | K | K | L | G | D | C | I | S | E | D | S | Y | P | D | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | B | S | S | B | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | T | W | Y | R | N | G | K | V | L | H | P | L | E | G | A | V | V | I | I | F | K | K | E | M | D | P | V | T | Q | L | Y | T | M | T | S | T | L | E | Y | K | T | T | K | A | D | I | Q | M | P | F | T | C | S | V | T | Y | Y | G | P | S | G | Q | K | T | I | H | S | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | T | T | B | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | F | D | I | Y | Y | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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