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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a10A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: thiocyanate forming protein; | PDBTitle: the crystal structure of ta-tfp, a thiocyanate-forming protein2 involved in glucosinolate breakdown (space group c2) |
Added to library: Sat Aug 29 08:34:09 2015 | |
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Sequence | S | P | E | F | M | A | R | T | L | Q | G | E | W | M | K | V | E | Q | K | G | G | Q | V | P | A | P | R | S | S | H | G | I | A | V | I | G | D | K | L | Y | C | F | G | G | E | D | P | P | Y | E | S | I | D | N | D | L | Y | V | F | D | F | N | T | H | T | W | S | I | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | S | T | T | B | S | T | T | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | N | G | D | V | P | K | T | R | V | L | G | T | R | M | V | A | V | G | T | K | L | Y | V | F | G | G | R | N | K | Q | L | E | F | E | D | F | Y | S | Y | D | T | V | K | E | E | W | K | F | L | T | K | L | D | E | K | G | G | P | E | A | R | T | F | H | S | M | T | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | S | T | T | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | N | H | V | Y | V | F | G | G | V | S | K | G | G | L | N | A | T | P | F | R | F | R | T | I | E | A | Y | N | I | A | E | G | K | W | A | Q | L | P | D | P | G | E | D | F | E | K | R | G | M | A | G | F | L | V | V | Q | G | K | L | W | V | F | Y | G | F | A | T | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | B | B | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | P | K | I | P | T | L | Y | G | S | Q | D | Y | E | S | N | R | V | H | C | Y | D | P | A | T | Q | K | W | T | E | V | E | T | T | G | F | E | K | P | S | R | R | S | C | F | A | H | A | A | V | G | K | Y | I | I | I | F | G | G | E | I | E | R | D | P | E | A | H | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | T | T | B | T | T | T | T | B | T | T | S | B | S | T | T | B | T | T | B | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | P | G | T | L | S | R | E | G | F | A | L | D | T | E | T | L | V | W | E | R | Y | E | G | G | P | I | K | P | S | N | R | G | W | V | A | S | T | T | T | T | I | N | G | K | K | G | L | L | V | H | G | G | K | L | M | T | N | E | R | T | D | E | M | Y | F | F | A | V | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | S | S | T | T | T | T | S | B | S |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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