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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a0nA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: protein f2 like fibronectin-binding protein; | PDBTitle: n-terminal thioester domain of protein f2 like fibronectin-2 binding protein from streptococcus pneumoniae |
Added to library: Sat Jun 6 08:16:04 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | G | F | P | N | D | A | K | G | I | S | G | N | G | K | Y | Y | S | L | G | Q | I | E | K | L | Y | S | N | Q | F | A | T | Y | N | N | L | T | V | I | T | S | D | T | H | E | N | S | D | N | F | A | F | C | L | A | N | G | K | R | F | P | S | F | T | D | E | K | P | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | B | B | G | G | G | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | Y | T | L | V | K | D | I | N | K | E | Q | Y | T | K | L | L | K | E | N | H | K | W | S | S | I | P | N | L | N | Q | A | W | D | T | F | S | R | L | S | Y | M | Y | L | K | D | P | T | D | I | V | K | R | A | W | G | T | D | L | N | T | A | R | T | Y | F | H | Q | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | Y | E | I | W | R | Y | T | D | G | M | R | V | S | S | D | T | N | V | Y | I | Y | E | K | F | S | P | Q | Q | K | K | A | L | E | M | I | R | T | D | L | Y | N | F | T | V | P | Y | E | N | L | E | Y | R | F | Y | K | P | D | W | V | F | G | L | G | F | Q | A | L | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | B |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | R | W | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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