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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a0gC_ | PDB header: cell adhesion | Chain: C: PDB Molecule: surface anchored protein; | PDBTitle: n-terminal thioester domain of surface protein from2 clostridium perfringens |
Added to library: Sat Jun 6 08:51:05 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | K | Y | K | G | Y | T | L | L | D | K | Y | P | K | E | D | D | F | R | D | A | I | Y | I | E | D | M | D | N | N | D | T | S | S | V | V | Y | C | F | N | V | T | K | A | T | P | T | F | K | G | S | V | V | K | V | L | Y | N | E | Q | F | G | S | S | K | L | F | T | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | S | B | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | K | P | R | V | K | G | D | E | L | K | N | S | V | L | R | V | I | Y | N | G | Y | P | S | N | A | L | G | I | K | E | K | Y | Q | L | T | E | G | Q | F | R | K | L | T | Q | R | A | V | W | N | F | T | D | S | N | L | S | L | D | K | L | S | Q | K | E | I | D | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | N | E | L | I | N | A | K | N | A | I | P | D | N | L | V | L | N | L | Y | L | P | D | D | S | Y | Y | Q | N | L | L | G | T | K | F | V | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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