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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4zppA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: mcg133388, isoform cra_f; | PDBTitle: crystal structure of protocadherin gamma c5 ec1-3 |
Added to library: Sat Oct 31 09:06:45 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | L | R | Y | S | V | V | E | E | S | E | P | G | T | L | V | G | N | V | A | Q | D | L | G | L | K | G | T | D | L | L | S | R | R | L | R | L | G | S | E | E | N | G | R | Y | F | S | L | S | L | V | S | G | A | L | A | V | S | Q | K | I | D | R | E | S | L | C | G | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | G | S | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | S | C | L | L | P | V | Q | V | V | T | E | H | P | L | E | L | T | R | V | E | V | E | I | L | D | L | N | D | N | S | P | S | F | A | T | P | D | R | E | M | R | I | S | E | S | A | A | P | G | A | R | F | P | L | D | S | A | Q | D | P | D | V | G | T | N | T | V | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T | T | B | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | T | L | S | P | N | S | H | F | S | L | H | V | K | T | L | K | D | G | K | L | F | P | E | L | V | L | E | Q | Q | L | D | R | E | T | Q | A | R | H | Q | L | V | L | T | A | V | D | G | G | T | P | A | R | S | G | T | S | L | I | S | V | I | V | L | D | V | N | D | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | T | F | Q | S | S | V | L | R | V | G | L | P | E | N | T | P | P | G | T | L | L | L | R | L | N | A | T | D | P | D | E | G | T | N | G | Q | L | D | Y | S | F | G | D | H | T | S | E | T | V | K | N | L | F | G | L | D | P | S | S | G | A | I | H | V | L | G | P | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G | G | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | F | E | E | S | N | F | Y | E | I | H | A | R | A | R | D | Q | G | Q | P | A | M | E | G | H | C | V | I | Q | V | D | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S |
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