|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4znlB_ | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: phage terminase large subunit; | PDBTitle: thermus phage p74-26 large terminase atpase domain bound to adp2 beryllium fluoride |
Added to library: Sat Jul 11 08:17:52 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | R | L | R | P | S | D | K | F | F | E | L | L | G | Y | K | P | H | H | V | Q | L | A | I | H | R | S | T | A | K | R | R | V | A | C | L | G | R | Q | S | G | K | S | E | A | A | S | V | E | A | V | F | E | L | F | A | R | P | G | S | Q | G | W | I | I | A | P | T | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | A | E | I | I | F | G | R | V | V | E | K | V | E | R | L | A | E | V | F | P | A | T | E | V | Q | L | Q | R | R | R | L | R | L | L | V | H | H | Y | D | R | P | V | N | A | P | G | A | K | R | V | A | T | S | E | F | R | G | K | S | A | D | R | P | D | N | L | R | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | L | D | F | V | I | L | D | E | A | A | M | I | P | F | S | V | W | S | E | A | I | E | P | T | L | S | V | R | D | G | W | A | L | I | I | S | T | P | K | G | L | N | W | F | Y | E | F | F | L | M | G | W | R | G | G | L | K | E | G | I | P | N | S | G | I | N | Q | T | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | S | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | B | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . |
Sequence | P | D | F | E | S | F | H | A | A | S | W | D | V | W | P | E | R | R | E | W | Y | M | E | R | R | L | Y | I | P | D | L | E | F | R | Q | E | Y | G | A | E | F | V | S | H | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | G | G | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|