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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4zi9A_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: mcg133388, isoform cra_t; | PDBTitle: structure of mouse clustered pcdhga1 ec1-3 |
Added to library: Sat Oct 31 08:46:59 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | I | R | Y | S | V | P | E | E | T | D | K | G | S | F | V | G | S | I | A | K | D | L | G | L | E | T | R | E | L | M | E | R | G | I | R | I | V | S | R | G | R | S | Q | L | F | S | L | N | P | R | S | G | S | L | V | T | A | G | R | I | D | R | E | E | L | C | A | Q | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | P | C | V | V | S | F | N | I | L | M | E | D | E | M | K | L | L | P | I | E | V | E | I | I | D | I | N | D | N | T | P | Q | F | Q | L | E | E | L | E | L | K | M | S | E | I | T | T | P | G | T | R | I | P | L | P | L | G | Q | D | L | D | V | G | I | N | S | L | Q | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T | T | B | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | Q | L | S | A | N | P | H | F | S | L | D | V | Q | Q | G | P | E | G | P | Q | Q | P | E | M | V | L | Q | R | P | L | D | R | E | K | D | A | V | H | Y | L | V | L | T | A | S | D | G | G | S | P | I | H | S | G | T | L | Q | I | H | V | Q | V | V | D | V | N | D | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | A | F | T | K | A | E | Y | H | V | S | V | P | E | N | V | P | L | G | T | R | L | L | K | V | N | A | T | D | P | D | E | G | A | N | G | R | V | T | Y | S | F | H | K | V | D | H | S | V | V | R | K | F | Q | L | D | A | Y | T | G | E | L | S | N | K | E | P | L | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | E | E | Y | K | V | Y | P | M | E | I | Q | A | Q | D | G | A | G | L | M | A | R | A | K | V | L | V | T | V | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S |
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