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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4z7eB_ | 1.50 | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: lmo1422 protein; |
Added to library: Sat Apr 16 08:17:35 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | I | T | I | A | G | K | L | G | A | E | P | E | I | L | I | N | M | Y | K | L | V | I | E | D | E | T | D | L | K | V | N | V | K | P | N | M | G | K | T | S | F | V | F | N | A | L | K | S | G | D | I | D | I | Y | P | E | F | T | G | T | V | L | E | T | F | L | K | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | K | T | H | D | P | E | E | V | Y | T | Q | A | R | D | G | L | A | K | D | F | D | M | T | Y | L | K | P | M | K | Y | N | N | T | Y | A | L | A | V | S | P | E | F | A | K | E | N | N | L | E | K | I | S | D | L | G | P | V | S | D | Q | V | K | A | G | F | T | L | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | B | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | D | R | S | D | G | Y | K | G | I | Q | D | K | Y | G | L | T | F | S | N | L | K | T | M | E | P | K | L | R | Y | N | A | I | K | S | G | D | I | N | L | L | D | A | Y | S | T | D | S | E | L | A | Q | Y | K | L | K | V | L | E | D | D | Q | Q | L | F | P | P | Y | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | T | S | S | T | T | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 |
Sequence | A | P | L | M | L | T | K | T | L | D | K | Y | P | E | L | K | K | P | L | N | K | L | A | G | K | I | T | D | D | E | M | R | K | M | N | Y | E | V | N | V | N | G | K | S | A | Y | T | V | A | K | D | Y | L | K | D | Q | G | I | I | K | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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