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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4z6gA_ | 2.65 | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5; |
Added to library: Sat Apr 9 08:38:53 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | E | R | D | R | V | Q | K | K | T | F | T | K | W | V | N | K | H | L | M | K | V | R | K | H | I | N | D | L | Y | E | D | L | R | D | G | H | N | L | I | S | L | L | E | V | L | S | G | I | K | L | P | R | E | K | G | R | M | R | F | H | R | L | Q | N | V | Q | I | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | F | L | K | Q | R | Q | V | K | L | V | N | I | R | N | D | D | I | T | D | G | N | P | K | L | T | L | G | L | I | W | T | I | I | L | H | F | Q | I | S | D | I | Y | I | S | G | E | S | G | D | M | S | A | K | E | K | L | L | L | W | T | Q | K | V | T | A | G | Y | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | K | C | T | N | F | S | S | C | W | S | D | G | K | M | F | N | A | L | I | H | R | Y | R | P | D | L | V | D | M | E | R | V | Q | I | Q | S | N | R | E | N | L | E | Q | A | F | E | V | A | E | R | L | G | V | T | R | L | L | D | A | E | D | V | D | V | P | S | P | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | S | V | I | T | Y | V | S | S | I | Y | D | A | F | P | K | V | P | E | G | G | E | G | I | S | A | T | E | V | D | S | R | W | Q | E | Y | Q | S | R | V | D | S | L | I | P | W | I | K | Q | H | T | I | L | M | S | D | N | Q | Y | I | H | F | K | E | T | E | I | L | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . |
Sequence | E | R | E | K | G | R | I | E | E | L | Y | K | L | L | E | V | W | I | E | F | G | R | I | K | L | P | Q | G | Y | H | P | N | D | V | E | E | E | W | G | K | L | I | I | E | M | L | E | R | E | K | S | L | R | P | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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