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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4z34A_ | PDB header: transport protein/inhibitor | Chain: A: PDB Molecule: lysophosphatidic acid receptor 1, soluble cytochrome b562; | PDBTitle: crystal structure of human lysophosphatidic acid receptor 1 in complex2 with ono9780307 |
Added to library: Sat Jun 6 09:30:23 2015 | |
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Sequence | N | E | P | Q | C | F | Y | N | E | S | I | A | F | F | Y | N | R | S | G | K | H | L | A | T | E | W | N | T | V | S | K | L | V | M | G | L | G | I | T | V | C | I | F | I | M | L | A | N | L | L | V | M | V | A | I | Y | V | N | R | R | F | H | F | P | I | Y | Y | L | M | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | L | A | A | A | D | F | F | A | G | L | A | Y | F | Y | L | M | F | N | T | G | P | N | T | R | R | L | T | V | S | T | W | L | L | R | Q | G | L | I | D | T | S | L | T | A | S | V | A | N | L | L | A | I | A | I | E | R | H | I | T | V | F | R | M | Q | L | H | T | R | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | N | R | R | V | V | V | V | I | V | V | I | W | T | M | A | I | V | M | G | A | I | P | S | V | G | W | N | C | I | C | D | I | E | N | C | S | N | M | A | P | L | Y | S | D | S | Y | L | V | F | W | A | I | F | N | L | V | T | F | V | V | M | V | V | L | Y | A | H | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | T | G | G | G | B | S | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | Y | V | A | D | L | E | D | N | W | E | T | L | N | D | N | L | K | V | I | E | K | A | D | N | A | A | Q | V | K | D | A | L | T | K | M | R | A | A | A | L | D | A | Q | K | A | M | K | D | F | R | H | G | F | D | I | L | V | G | Q | I | D | D | A | L | K | L | A | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | G | K | V | K | E | A | Q | A | A | A | E | Q | L | K | T | T | R | N | A | Y | I | Q | K | Y | L | R | N | R | D | T | M | M | S | L | L | K | T | V | V | I | V | L | G | A | F | I | I | C | W | T | P | G | L | V | L | L | L | L | D | V | C | C | P | Q | C | D | V | L | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | K | F | F | L | L | L | A | E | F | N | S | A | M | N | P | I | I | Y | S | Y | R | D | K | E | M | S | A | T | F | R | Q | I | L | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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