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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4z2mB_ | 2.98 | PDB header: transcription/dna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: fact complex subunit spt16; |
Added to library: Sat Mar 12 08:40:49 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | K | Q | D | S | L | V | I | N | L | N | R | S | N | P | K | L | K | D | L | Y | I | R | P | N | I | A | Q | K | R | M | Q | G | S | L | E | A | H | V | N | G | F | R | F | T | S | V | R | G | D | K | V | D | I | L | Y | N | N | I | K | H | A | L | F | Q | P | C | D | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | I | I | V | L | H | F | H | L | K | N | A | I | M | F | G | K | K | R | H | T | D | V | Q | F | Y | T | E | V | G | E | I | T | T | D | D | D | L | Y | A | E | Q | M | E | R | E | M | R | H | K | L | K | T | A | F | K | N | F | I | E | K | V | E | A | L | T | K | E | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | F | E | V | P | F | R | D | L | G | F | N | G | A | P | Y | R | S | T | C | L | L | Q | P | T | S | S | A | L | V | N | A | T | E | W | P | P | F | V | V | T | L | D | E | V | E | L | I | H | F | E | R | V | Q | F | H | L | K | N | F | D | M | V | I | V | Y | K | D | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . |
Sequence | K | K | V | T | M | I | N | A | I | P | V | A | S | L | D | P | I | K | E | W | L | N | S | C | D | L | K | Y | T | E | G | V | Q | S | L | N | W | T | K | I | M | K | T | I | V | D | D | P | E | G | F | F | E | Q | G | G | W | S | F | L | E | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G | G | T | T | G | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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