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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yv7A_ | PDB header: solute-binding protein | Chain: A: PDB Molecule: periplasmic binding protein/laci transcriptional regulator; | PDBTitle: crystal structure of an abc transporter solute binding protein2 (ipr025997) from mycobacterium smegmatis (msmei_3018, target efi-3 511327) with bound glycerol |
Added to library: Sat Apr 4 09:29:53 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | L | K | I | G | F | S | Q | A | T | Q | Q | S | P | F | Y | V | A | L | T | D | A | A | K | A | E | A | Q | A | Q | G | D | E | L | F | Y | A | D | A | N | G | D | I | T | K | Q | N | N | D | V | Q | D | L | I | T | R | G | I | N | V | L | V | I | N | P | V | D | P | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | T | P | S | L | A | A | A | E | A | A | G | I | K | V | V | T | V | D | R | P | V | E | S | G | A | A | S | F | V | G | R | D | N | K | A | X | G | E | L | V | G | K | A | A | V | D | T | L | G | P | D | G | G | K | I | I | E | I | Q | G | D | A | G | G | A | V | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | R | R | D | G | F | Q | A | A | V | S | G | R | P | N | I | T | I | V | E | G | P | Y | C | D | Y | I | R | S | K | A | V | T | A | X | Q | D | L | L | Q | A | H | P | D | L | K | G | V | Y | A | Q | N | D | D | X | A | L | G | A | X | Q | V | L | A | E | N | N | R | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | K | V | F | G | V | D | G | L | X | E | A | V | R | A | I | A | D | G | D | Q | Y | V | A | T | A | L | N | D | P | D | A | E | G | R | L | A | I | Q | T | A | A | K | V | A | R | G | E | S | V | P | E | F | V | D | A | G | T | G | L | V | D | K | S | N | A | S | A | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | B | S | S | B | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | Q | S | T | F | A | A | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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